Veuillez noter que les questions ci-dessous traitent de questions générales concernant CACHE et que les dates limites, les procédures et les frais de participation varient d’un défi CACHE à l’autre. Pour obtenir les informations les plus récentes sur chaque défi CACHE, veuillez consulter le site Web du CACHE.
Pour toute question d’ordre général concernant Conscience, la science ouverte et nos autres programmes, veuillez consulter la page FAQ générale.
À propos de CACHE
Que sont les défis CACHE ?
Les défis CACHE (Critical Assessment of Computational Hit-finding Experiments) sont des concours ouverts destinés à combler le fossé entre les prédictions informatiques et la validation expérimentale dans le monde réel dans le domaine de la découverte de médicaments. Ils invitent les chercheurs issus du monde universitaire, de l’industrie et des organisations à but non lucratif à tester leurs meilleures méthodes informatiques pour prédire les points de départ potentiels de médicaments. CACHE valide ensuite ces prédictions de manière expérimentale en laboratoire, et tous les résultats sont partagés ouvertement. L’objectif est de créer des références reproductibles, d’améliorer les outils d’IA pour la découverte de médicaments et de favoriser la collaboration entre les secteurs et les universités.
Participation et candidatures
Qui peut participer ?
Les laboratoires universitaires, les entreprises biotechnologiques et pharmaceutiques, ainsi que les développeurs de logiciels utilisant des méthodes informatiques de recherche de molécules actives peuvent participer.
Comment postuler ?
Les candidatures pour chaque défi sont soumises via le site Web du CACHE et examinées dans le cadre d’un processus d’évaluation par les pairs en double aveugle supervisé par le comité d’examen des candidatures. Les participants sélectionnés sont informés par e-mail.
Puis-je mettre à jour ma candidature avant la date limite ?
Oui. Les candidatures peuvent être modifiées et soumises à nouveau à tout moment jusqu’à la date limite officielle de soumission.
Combien de temps dure un défi ?
La durée des défis varie, mais la plupart sont menés à bien en 18 à 24 mois environ, y compris les phases de prévision, les tests expérimentaux et la publication des données.
Dois-je signer un accord de participation ?
En soumettant leur candidature à un défi, les participants acceptent les conditions de participation du CACHE en leur nom et au nom de leur organisation. Ces conditions sont accessibles au public sur le site web du CACHE.
Coûts et soutien
Comment les coûts sont-ils ventilés ?
CACHE couvre actuellement tous les tests expérimentaux nécessaires à la validation. Les participants sont responsables du coût d’acquisition ou de synthèse des composés qu’ils proposent, sauf indication contraire. Les participants sont invités à consulter la page « Annonce » de chaque défi pour connaître la répartition détaillée des coûts.
Existe-t-il des subventions pour les participants ?
Oui. Les universitaires et les PME canadiennes admissibles peuvent obtenir le remboursement d’une partie des coûts liés à l’approvisionnement en matériaux composites, à la main-d’œuvre directe et à l’équipement. Le pourcentage de remboursement varie selon le défi.
Y a-t-il une limite au nombre de composés que je peux soumettre ?
Oui. Chaque défi impose une limite au nombre de composés que chaque participant peut soumettre — généralement jusqu’à 100 composés au premier tour et jusqu’à 50 analogues chimiques au deuxième tour.
Comment passer des commandes composées auprès d’Enamine ?
Toutes les commandes de composés auprès d’Enamine sont coordonnées par le directeur des opérations de CACHE, qui passe une seule commande groupée au nom de tous les participants. Les participants qui ne soumettent pas leur liste définitive de composés avant la date limite ne seront pas inclus dans la commande et risquent de perdre leur place dans le défi.
Quel est le coût total estimé pour participer à un défi CACHE ?
Le coût total estimé par tour est d’environ 50 000 dollars américains. Cette estimation comprend les salaires de deux employés à temps plein pendant deux mois, les achats de matériaux composites, les frais informatiques et l’équipement. Chaque défi comporte deux tours, le coût total pour les participants sélectionnés pour le deuxième tour est donc d’environ 100 000 dollars américains.
Évaluation et résultats
Comment les résultats sont-ils évalués ?
Les critères d’évaluation varient selon les défis. Les indicateurs comprennent généralement : le taux de réussite (liants efficaces), l’affinité de liaison, les propriétés physico-chimiques, les performances par rapport aux sélections groupées et/ou les évaluations par des pairs experts.
Quand les résultats sont-ils communiqués ?
Après chaque cycle de prédiction, les données expérimentales sont communiquées aux participants en toute confidentialité. Cela comprend à la fois les données d’analyse et les scores de performance de leurs composés. Les résultats finaux sont rendus publics après une période d’embargo de trois mois suivant la fin du défi.
Détails pratiques
Que faire si je perds mon identifiant/code d’application ?
Si vous oubliez votre identifiant ou votre code, vous pouvez demander à ce qu’ils vous soient envoyés en cliquant sur « Mot de passe oublié » sur la page de connexion des participants et en saisissant votre adresse e-mail de candidat. Pour toute autre demande d’accès, veuillez contacter [email protected] pour obtenir de l’aide.
Que se passe-t-il si je me retire d’un défi ?
Si un participant décide de se retirer d’un défi, ses droits de participation peuvent être résiliés, mais les obligations relatives à la propriété intellectuelle et aux licences du défi resteront applicables. Pour plus d’informations, consultez les questions ci-dessous sur la propriété intellectuelle.
Données, propriété intellectuelle et publications
Qui détient la propriété intellectuelle issue de la participation à un défi ?
Votre propre travail (propriété intellectuelle de base) : les participants conservent la propriété de leurs méthodes, codes et travaux antérieurs.
Résultats du défi (propriété intellectuelle du défi) : les composés, données et structures produits pendant le défi sont partagés ouvertement sous des licences telles que CC BY 4.0. Conformément aux conditions de participation, les participants s’engagent à ne pas breveter ces résultats, garantissant ainsi leur accessibilité à l’ensemble de la communauté scientifique.
Les résultats des défis CACHE seront-ils publiés ?
Oui. CACHE publie des articles conjoints avec les participants qualifiés (c’est-à-dire ceux qui ont terminé les deux cycles de prédictions et de validation expérimentale) après chaque défi. Les participants sont également libres de publier de manière indépendante, et sont priés de mentionner CACHE/Conscience de manière appropriée.
Puis-je participer anonymement ?
Tous les participants peuvent rester anonymes pendant toute la durée du défi. Conformément à la section 4.6 des conditions de participation. Les trois participants les plus performants sont automatiquement désanonymisés à la fin du défi. Tous les autres participants sont invités à indiquer s’ils souhaitent être désanonymisés, auquel cas leurs noms seront publiés sur le site web du CACHE avec les résultats du défi.
Dois-je partager mes méthodes de calcul exclusives ?
Non, les méthodes et le code propriétaires (propriété intellectuelle de base) n’ont pas besoin d’être divulgués. Les participants sont uniquement tenus de fournir un résumé descriptif de leur flux de travail, afin que les autres puissent comprendre l’approche sans révéler de détails sensibles.
